مردان ایکس یک تیم نخبه از جهش‌یافته‌ها هستند، انسان‌های با استعداد ژنتیکی که دارای قدرت‌های فوق‌العاده هستند و سوگند خورده‌اند که برای حقوق جهش‌یافته‌ها در برابر سازمان‌های دولتی خصمانه مبارزه کنند، در حالی که همزمان از بشریت در برابر مگنتو، نژادپرست جهش‌یافته که به دنبال نابودی نژاد بشر به خاطر جنایات انجام شده علیه نوع جهش‌یافته است، محافظت کنند.